微生物实验室承担菌种培养、微生物检测工作，存在生物气溶胶风险，净化建设既要满足实验操作需求，同时做好生物安全防护，很多单位建设时重装修外观，忽视通风压差，埋下安全隐患。
微生物实验室要做好功能分区，清洁区、缓冲间、操作区合理划分，严格管控压差梯度，防止微生物气溶胶向外扩散。通风排风系统是重中之重，排风需要经过过滤处理再排放；围护选用耐腐蚀净化板材，地面无缝无死角，方便消毒清洁。
不同海拔气候对实验室方案影响很大，高原地区要解决低压新风增压、设备防冻；南方高湿地区重点处理防潮防霉。新建实验室可以全盘规划，旧房屋改造微生物实验室，需要评估原有建筑水电、排风条件，针对性改造。
微生物实验室建成投入使用，不等于工作结束，要建立定期维护制度，定期更换过滤器，巡检通风空调系统，记录压差温湿度，保障实验室长期安全运行
